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肖远发现问题，是在对03:12:31以后的数据包的分析过程中，这时不同的数据包并不完全相同，说明世界还没有完全静止下来。
分析工具一边比对每一次的内存数据样本，一边将这些数据以图表的形式展示出来，便于肖远更直观的观察这些数据的变化特征，只不过因为分析数据要花费一定的时间，所以，图像的变化比起god程序的监控图像来，变化慢了很多。
因为这里的图像和god监控程序的显示原理一样，所以显示出来的图形也与那里的完全相同，刚开始的时候，图像上一个与其他地方有着明显分别区域在缓慢的四处移动，肖远知道这个漩涡是种子的代码在世界中的映像。
看着种子的映像仍然存在，肖远想起第一阶段的分析中，那些不再发生变化的内存影像中，好像种子不见了。
“它难道被抹杀了？”肖远盯着电脑屏幕上的分析过程，心中暗暗思忖，“不应该的，如果种子被抹杀的话，god应该会很快就将世界的平衡恢复，但是事实是没有恢复，这其中一定发生了什么我没有想到的事情。”
“咦，怎么回事？”正在思考的时候，肖远发现原本在图像上还十分明显，一眼就能分辨出来的种子突然消失了，接下来图像又变化了两帧，就静止了，既没有继续恢复平衡，也没有因为不平衡而继续变化下去。
肖远暂停了分析软件，从图像静止下来的时间点提取了一个内存样本，拿来和最后的内存样本文件进行了对比——完全一样。
“种子突然消失了，然后god也不工作了，有点儿像同归于尽。”
肖远再次回放了刚才的图像演变过程，瞪大了眼睛盯着屏幕上的图像，想要看清楚在图像消失的一瞬间，究竟发生了什么，但是却一无所获。
于是他干脆不让图形自动运行了，而是手动让这些图像一帧一帧的出现，仔细观察，在图像消失的上一帧停了下来，仔细观察了一下，仍然是没有发现什么问题，于是他将这一帧的内存样本提取了出来，从中将种子的代码单独提取了出来，对其进行了反汇编。
得到种子程序这一时刻的汇编程序后，肖远发现得到的它和种子未放入世界进行进化之前的程序相比，已经发生了很大变化，阅读时给他的感觉就像在阅读一段全新的程序一样，要知道这个程序根本就是出自他手。
“看来种子真的自我进化了，只是它为什么会自动消失呢？”肖远努力在代码中寻找着种子自动消失的痕迹。
将程序通读了一遍，肖远发现进化后的种子程序无论是长度还是复杂性都增加了很多，其中存在一段奇异的代码。
“这应该就是种子能够突然消失的原因了。”肖远觉得自己似乎已经找到了答案，但是这段代码很晦涩，难以理解，这让他感到有些受伤。
“见鬼了。”肖远不由得骂了一句，然后反复读了几遍这段代码，并将其中涉及到的寄存器，以及寄存器之间的数据流向绘制成了图像，并找来一本这台工作站的cpu编码的详细手册，一点一点儿加以对照。
所谓读书百遍，其义自现，程序也是如此，反复读过几遍后，肖远越来越觉得这两端程序有些非比寻常，并有种隐隐的预感，读懂这两端程序将是他解开种子程序以及god程序反常表现的关键所在。
终于，肖远从这些代码中找到了最关键的逻辑，却被他... -->>
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