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降落在陆地上歇息的树巢人并不适应这样的隔海飞行，这时海面上的气流也躁动不安，只有少数人飞了过去，随着陆地相隔约来越远，飞跃的难度逐渐增加，看着前面飞到中途掉落海水被游水族抓捕的同胞，陆地上的树巢人逐渐放弃了飞跃海洋的打算。
就这样，柯木巴星球的海陆布局呈现出现在这样四分五裂的大陆割裂状态。
定居在不同板块的树巢族和洞穴族两个族群内部彼此隔离发展，两族群长期混居共生。但是游水族因为海洋将陆地割裂开，他们能够进入到更多的淡水区域，几乎掌控了整个柯木巴星球的水系交通。
游水族狂暴的领袖，发起了一场极具破坏力的战争，除了对两组人造成严重的伤亡打击，游水族发动战争这件事本身也给本族人带来了极大的损失，海内因地质运动带来毁天灭地的震动，游水族也有大量族人伤亡。震动停止之后，原来的生态平衡被打破，导致很多无法在海水中生存的生物在那一场灾难中大量死亡。
喜水生物疯狂生长，游水族在恢复期的生存压力陡增，当初的主战派和主和派的矛盾一再被激发，随后主和派的领袖带领部分族人沿江河深入陆地内部，力图为自己族人带来的破坏做出弥补，且拒绝主战派靠近内陆水系。
主战派之后便一直驻守在深海区，在狂暴领袖去世之后，后人在重建家园的过程中逐渐意识到战争带来的代价，有了先人的教训以及主和派的阻挠，他们逐渐失去了和陆地的联结，成为了孤海族群。
令研究者们惊讶的地方在于游水族的文明发展速度与高度明显高于另外两族人，他们已经拥有自己明确的组织形式、能够组织并发动战争、能够为自己的信念做出选择与斗争，但是为何之后数千年的发展中，游水族十分低调，通过外星观测活动难以发现他们的文明踪迹。
除此之外，更令研究者们困惑不已的是，游水族是如何发动这场破坏的，这像极了星球地质内部自发出现的变化，因为在灾难发生之时，没有任何痕迹表面游水族使用了某种工具或者力量促进了这一变化的产生，但又有证据表明在灾难发生之前，游水族有大规模的复杂的集体行为，像极了在为一场策划很久的政变正在展开行动，最终促成了整个星球的内部爆裂。
相反，在游水族发动战争时，仍处于懵懂状态的洞穴族和树巢族，并没有意识到这是来自另一族群的主观破坏与毁灭，而是将其当做自然灾难，在之后的上千年的发展中，自我意识逐渐萌生，文明活动持续缓慢发展。
发展至今，除了游水族难以发现活动踪迹，洞穴族和树巢族这两种陆生族已进入类似地球的新石器时代。
火种号星际母舰的任务便是，由起航时航行员的后代携带文明火种，与柯木巴土著文明进行嫁接，完成火种号星际航行的终极使命——让现有地球文明与当地土著人及土著文明融合，使得柯木巴文明可以站在地球文明的“肩膀”上进一步发展、探索更高级的文明。
第二部分：系统初始条件概述
系统历史背景与生态环境同柯木巴星球已有研究发现；
程序设定陆生人以原始部落群居的社会结构开始，每一位陆生程序人的初始源代码设定为“生存、繁衍、传承、发展”；
游水人为隐藏变量，录入已知研究发现和未解谜题，设置开放源代码，在后续系统运作中动态观测、校正；
所有程序人应用机器学习技术；
程序无创造新事物的技术，所生产的文明均以地球已有文明作为信息库，自动索引适当的词汇、语料、书册作为可表征当下文明状态的精神物质产物；
为了资源的重复利用，以存储大量信息的“人种”模块为例，常见的，以消耗-回收-重新配置的方式进行重置利用，少数以解绑-重新关联的方式进行重新配置。